渔业对环境有各种负面的影响：从养渔场排放出的废弃物和放流水可能对野生鱼类、海豹和贝类造成危害。养渔业者使用少量高毒性的化学物质来杀死虱子：一旦过量即会造成灾害。使用拖网常捕获非商业性鱼类，其排钩操作和长线捕鱼的方式是造成大型海洋动物和濒临绝种动物死亡的原因之一。有些捕鱼技术，如拖网，不但捕得吨计的鱼获，更杀死数以百万的鸟类、鲸鱼、海豹、和意外捕捉到的鱼类；小小的网孔经常补捉到尚未成长、还未来得及繁殖的幼鱼。 有些设备也破坏了自然栖息地，如拖网的底部可能破坏自然礁石。其他破坏性的技术如非法炸鱼和用氰化物毒鱼。
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